Диоп Шейх Анта родился 29 декабря 1923 года в Диурбеле (Сенегал). С ранних лет учился в мусульманской школе, в 22 года окончил университет в Дакарте. Затем уехал во Францию, где продолжил обучение в Сорбонне. Изучал химию, физику, историю, археологию, философию, лингвистику, социологию. Увлекался изучением истории Африки. Эта тема легла в основу его скандальной диссертации «Негрские нации и культура».
В 1971 году занял пост вице-президента комитета по подготовке масштабного исторического исследования «Всеобщая история Африки», выходившего под эгидой ЮНЕСКО. Занимал пост профессора Дакарского университета.
Получил известность как египтолог, придерживался нестандартных взглядов на историю древнего Египта. Его труды несут идеи афроцентризма. Диоп считал, что достижения древних негроафриканских культур сформировали цивилизацию древнего Египта и через культурный обмен между народами дали культурный толчок древней Греции и Риму.
Он утверждал о первичности негроафриканских народов, считал, что европейская и монголоидная расы появились позже, как ветви африканских народов. Его исторические труды нельзя считать идеологически бесстрастными, так как Диоп являлся одним из лидеров антиколониального движения.
Наследие Диопа Шейх Анта неоднозначно и подлежит критическому осмыслению, но несмотря на это его авторитет как ученого широко признавался. После его смерти 7 февраля 1986 года, его именем был назван Дакарский университет.