Агостиньо Нето родился 17 сентября 1922 года в семье протестантского пастора. С 1947 года Агостиньо жил в Португалии. Обучался в лицее Луанды Сан-Сальвадор и Лиссабонском университете.
В начале 1950-х годов под руководством созданной Нето организации МПЛА в Анголе развернулась борьба за независимость. Он находился в заключении за участие в национально-освободительном движении в 1955–1957 годах.
После освобождения Агостиньо Нето окончил медицинский факультет университета в городе Коимбра и вернулся в Анголу. Здесь он вступает в Народное движение за освобождение Анголы (МПЛА).
Его деятельность приводит в 1961 году вновь к заключению в тюрьму, которое позднее сменяется на домашний арест. В 1962 году Нето совершает побег в Марокко, откуда перебирается в Демократическую республику Конго. Ко времени получения независимости его движение контролировало значительную часть территории страны.
В 1975 году Агостиньо Нето становится первым президентом Анголы и провозглашает курс на строительство социализма. В это время в стране царила экономическая разруха, причиной тому было изгнание всех португальских специалистов после провозглашения независимости, а также вторжение в страну войск Заира и армии ЮАР. Нето обратился за помощью к СССР и Кубе, и в результате совместных усилий иностранные войска были разгромлены.
Агостиньо Нето скончался в Москве 10 сентября 1979 года.